螞蟻男孩佩爾比以往任何時候都受人關注,他打敗了仇敵“跳蚤”,現在跳蚤被關進了一家研究所的監獄里佩爾轉眼13歲了,他也已經習慣了超級英雄的身份。在理想狀態中,佩爾的搭檔艾達會是他的女友,但現實的情況是復雜的,艾達現在有一個意想不到的對手那就是學校里一個小男孩,這個小男孩獨來獨往,他不僅不斷阻止艾達接近佩爾,而且還是一位比跳蚤還要厲害的對手。更可怕的是,佩爾逐漸發現自己被控制,但是現在他遇到了一個新的也更強大的敵人,敵人有隱身的技能,難以琢磨,經常使他陷入困境之中,此時,一個超級大反派也宣布到來,佩爾面臨著前所未有的挑戰ddd